Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ly9Q01965 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ly9Q01965 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms