Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
F8a1Q00558 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
F8a1Q00558 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
F8a1Q00558 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms