Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gabpb1Q00420 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb1Q00420 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms