Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Prop1P97458 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Prop1P97458 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prop1P97458 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prop1P97458 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prop1P97458 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prop1P97458 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prop1P97458 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Prop1P97458 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prop1P97458 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prop1P97458 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prop1P97458 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prop1P97458 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prop1P97458 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prop1P97458 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Prop1P97458 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Prop1P97458 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prop1P97458 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prop1P97458 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms