Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pkp1P97350 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkp1P97350 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms