Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Vgll3P85442 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Vgll3P85442 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms