Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NyxP83503 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NyxP83503 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NyxP83503 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NyxP83503 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NyxP83503 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NyxP83503 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NyxP83503 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NyxP83503 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NyxP83503 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NyxP83503 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NyxP83503 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NyxP83503 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NyxP83503 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NyxP83503 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NyxP83503 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NyxP83503 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NyxP83503 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NyxP83503 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NyxP83503 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NyxP83503 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NyxP83503 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NyxP83503 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NyxP83503 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NyxP83503 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NyxP83503 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NyxP83503 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NyxP83503 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NyxP83503 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NyxP83503 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NyxP83503 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NyxP83503 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NyxP83503 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NyxP83503 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NyxP83503 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NyxP83503 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NyxP83503 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NyxP83503 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NyxP83503 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NyxP83503 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NyxP83503 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NyxP83503 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NyxP83503 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NyxP83503 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NyxP83503 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NyxP83503 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NyxP83503 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NyxP83503 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NyxP83503 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NyxP83503 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NyxP83503 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NyxP83503 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NyxP83503 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NyxP83503 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NyxP83503 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NyxP83503 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NyxP83503 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NyxP83503 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NyxP83503 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NyxP83503 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NyxP83503 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NyxP83503 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NyxP83503 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NyxP83503 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NyxP83503 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NyxP83503 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NyxP83503 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NyxP83503 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NyxP83503 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NyxP83503 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NyxP83503 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NyxP83503 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NyxP83503 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NyxP83503 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NyxP83503 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NyxP83503 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NyxP83503 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NyxP83503 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NyxP83503 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NyxP83503 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NyxP83503 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NyxP83503 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NyxP83503 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NyxP83503 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NyxP83503 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NyxP83503 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NyxP83503 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NyxP83503 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NyxP83503 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NyxP83503 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NyxP83503 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NyxP83503 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NyxP83503 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NyxP83503 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NyxP83503 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NyxP83503 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NyxP83503 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NyxP83503 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NyxP83503 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NyxP83503 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms