Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Polr1bP70700 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Polr1bP70700 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms