Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rad50P70388 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad50P70388 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad50P70388 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad50P70388 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad50P70388 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rad50P70388 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad50P70388 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms