Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufd1P70362 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufd1P70362 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms