Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps27aP62983 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps27aP62983 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms