Protein–RNA interactions for Protein: P62962

Pfn1, Profilin-1, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn1P62962 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pfn1P62962 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Pfn1P62962 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pfn1P62962 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pfn1P62962 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pfn1P62962 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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