Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ElobP62869 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ElobP62869 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ElobP62869 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ElobP62869 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ElobP62869 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ElobP62869 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ElobP62869 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ElobP62869 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ElobP62869 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ElobP62869 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ElobP62869 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ElobP62869 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ElobP62869 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ElobP62869 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ElobP62869 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ElobP62869 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ElobP62869 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ElobP62869 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ElobP62869 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ElobP62869 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ElobP62869 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ElobP62869 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ElobP62869 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ElobP62869 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ElobP62869 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ElobP62869 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ElobP62869 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ElobP62869 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ElobP62869 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ElobP62869 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ElobP62869 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ElobP62869 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ElobP62869 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ElobP62869 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ElobP62869 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ElobP62869 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ElobP62869 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ElobP62869 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ElobP62869 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ElobP62869 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ElobP62869 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ElobP62869 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ElobP62869 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ElobP62869 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ElobP62869 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ElobP62869 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ElobP62869 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ElobP62869 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ElobP62869 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ElobP62869 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ElobP62869 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ElobP62869 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ElobP62869 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ElobP62869 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms