Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabra1P62812 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264.6 ms