Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta2P62737 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta2P62737 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta2P62737 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta2P62737 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Acta2P62737 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Acta2P62737 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Acta2P62737 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Acta2P62737 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Acta2P62737 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta2P62737 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta2P62737 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta2P62737 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta2P62737 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta2P62737 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta2P62737 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta2P62737 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta2P62737 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms