Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fgf1P61148 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fgf1P61148 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms