Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppfia3P60469 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppfia3P60469 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms