Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtnsP57757 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtnsP57757 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtnsP57757 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtnsP57757 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtnsP57757 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtnsP57757 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms