Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp25P57080 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp25P57080 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp25P57080 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp25P57080 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp25P57080 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp25P57080 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Usp25P57080 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp25P57080 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp25P57080 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp25P57080 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp25P57080 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp25P57080 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp25P57080 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp25P57080 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp25P57080 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp25P57080 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp25P57080 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp25P57080 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp25P57080 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp25P57080 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp25P57080 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp25P57080 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp25P57080 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp25P57080 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp25P57080 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp25P57080 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp25P57080 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp25P57080 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Usp25P57080 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Usp25P57080 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp25P57080 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp25P57080 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp25P57080 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp25P57080 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp25P57080 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp25P57080 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp25P57080 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp25P57080 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp25P57080 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp25P57080 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp25P57080 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp25P57080 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp25P57080 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp25P57080 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp25P57080 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp25P57080 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp25P57080 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp25P57080 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp25P57080 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp25P57080 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp25P57080 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp25P57080 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp25P57080 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp25P57080 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp25P57080 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp25P57080 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp25P57080 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp25P57080 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp25P57080 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp25P57080 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp25P57080 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp25P57080 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp25P57080 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp25P57080 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp25P57080 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms