Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn18P56857 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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