Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab4aP56371 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rab4aP56371 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rab4aP56371 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rab4aP56371 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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