Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEMP55040 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEMP55040 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEMP55040 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEMP55040 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GEMP55040 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GEMP55040 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEMP55040 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEMP55040 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEMP55040 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEMP55040 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEMP55040 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEMP55040 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GEMP55040 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEMP55040 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GEMP55040 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEMP55040 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEMP55040 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEMP55040 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEMP55040 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GEMP55040 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEMP55040 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEMP55040 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEMP55040 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEMP55040 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEMP55040 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GEMP55040 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEMP55040 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GEMP55040 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEMP55040 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEMP55040 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEMP55040 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEMP55040 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEMP55040 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GEMP55040 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEMP55040 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEMP55040 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEMP55040 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEMP55040 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEMP55040 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEMP55040 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEMP55040 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEMP55040 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEMP55040 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEMP55040 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEMP55040 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GEMP55040 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEMP55040 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEMP55040 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEMP55040 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEMP55040 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEMP55040 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEMP55040 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEMP55040 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEMP55040 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEMP55040 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEMP55040 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEMP55040 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GEMP55040 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEMP55040 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEMP55040 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEMP55040 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEMP55040 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEMP55040 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEMP55040 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GEMP55040 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEMP55040 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEMP55040 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEMP55040 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEMP55040 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEMP55040 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GEMP55040 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEMP55040 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEMP55040 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GEMP55040 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEMP55040 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEMP55040 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEMP55040 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEMP55040 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEMP55040 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEMP55040 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GEMP55040 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms