Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms