Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ube2e1P52482 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2e1P52482 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms