Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApodP51910 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApodP51910 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApodP51910 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApodP51910 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApodP51910 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApodP51910 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApodP51910 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApodP51910 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApodP51910 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ApodP51910 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApodP51910 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApodP51910 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApodP51910 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApodP51910 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ApodP51910 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ApodP51910 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ApodP51910 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ApodP51910 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ApodP51910 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ApodP51910 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ApodP51910 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ApodP51910 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ApodP51910 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ApodP51910 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ApodP51910 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ApodP51910 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ApodP51910 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ApodP51910 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ApodP51910 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ApodP51910 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ApodP51910 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ApodP51910 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ApodP51910 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ApodP51910 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ApodP51910 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ApodP51910 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ApodP51910 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ApodP51910 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ApodP51910 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ApodP51910 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ApodP51910 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ApodP51910 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ApodP51910 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ApodP51910 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ApodP51910 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ApodP51910 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ApodP51910 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ApodP51910 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ApodP51910 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ApodP51910 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ApodP51910 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ApodP51910 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ApodP51910 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ApodP51910 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ApodP51910 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ApodP51910 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ApodP51910 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ApodP51910 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ApodP51910 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ApodP51910 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApodP51910 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ApodP51910 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ApodP51910 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApodP51910 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApodP51910 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ApodP51910 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApodP51910 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApodP51910 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApodP51910 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApodP51910 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApodP51910 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApodP51910 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApodP51910 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApodP51910 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApodP51910 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ApodP51910 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApodP51910 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApodP51910 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApodP51910 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApodP51910 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApodP51910 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApodP51910 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApodP51910 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApodP51910 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ApodP51910 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApodP51910 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApodP51910 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApodP51910 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApodP51910 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApodP51910 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ApodP51910 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApodP51910 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApodP51910 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApodP51910 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApodP51910 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApodP51910 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApodP51910 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ApodP51910 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApodP51910 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms