Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Defa-rs12P50716 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa-rs12P50716 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms