Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SftpdP50404 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SftpdP50404 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SftpdP50404 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SftpdP50404 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SftpdP50404 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SftpdP50404 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SftpdP50404 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SftpdP50404 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SftpdP50404 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SftpdP50404 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SftpdP50404 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SftpdP50404 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SftpdP50404 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SftpdP50404 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SftpdP50404 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SftpdP50404 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SftpdP50404 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SftpdP50404 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SftpdP50404 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SftpdP50404 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SftpdP50404 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SftpdP50404 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SftpdP50404 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SftpdP50404 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SftpdP50404 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SftpdP50404 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SftpdP50404 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms