Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbp3P49194 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
Rbp3P49194 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbp3P49194 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbp3P49194 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbp3P49194 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbp3P49194 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rbp3P49194 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms