Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nkx1-2P42580 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nkx1-2P42580 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nkx1-2P42580 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188 ms