Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf2P39429 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf2P39429 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf2P39429 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf2P39429 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf2P39429 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf2P39429 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf2P39429 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf2P39429 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf2P39429 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf2P39429 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf2P39429 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf2P39429 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf2P39429 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf2P39429 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf2P39429 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms