Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin1P35438 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin1P35438 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin1P35438 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin1P35438 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin1P35438 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin1P35438 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin1P35438 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin1P35438 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin1P35438 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Grin1P35438 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin1P35438 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin1P35438 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Grin1P35438 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin1P35438 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Grin1P35438 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Grin1P35438 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin1P35438 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin1P35438 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin1P35438 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin1P35438 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin1P35438 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin1P35438 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin1P35438 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin1P35438 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Grin1P35438 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin1P35438 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Grin1P35438 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Grin1P35438 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin1P35438 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin1P35438 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Grin1P35438 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin1P35438 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin1P35438 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin1P35438 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin1P35438 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin1P35438 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin1P35438 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Grin1P35438 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Grin1P35438 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin1P35438 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin1P35438 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin1P35438 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin1P35438 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Grin1P35438 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin1P35438 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin1P35438 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grin1P35438 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin1P35438 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin1P35438 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin1P35438 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin1P35438 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Grin1P35438 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin1P35438 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin1P35438 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin1P35438 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Grin1P35438 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin1P35438 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin1P35438 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin1P35438 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin1P35438 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin1P35438 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grin1P35438 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grin1P35438 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms