Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab17P35292 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab17P35292 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab17P35292 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab17P35292 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab17P35292 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms