Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctnnd1P30999 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctnnd1P30999 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms