Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccnd2P30280 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccnd2P30280 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccnd2P30280 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccnd2P30280 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccnd2P30280 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccnd2P30280 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccnd2P30280 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccnd2P30280 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccnd2P30280 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccnd2P30280 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccnd2P30280 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccnd2P30280 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd2P30280 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnd2P30280 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnd2P30280 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnd2P30280 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnd2P30280 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnd2P30280 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnd2P30280 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnd2P30280 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnd2P30280 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms