Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RxraP28700 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RxraP28700 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RxraP28700 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RxraP28700 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RxraP28700 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RxraP28700 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RxraP28700 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RxraP28700 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RxraP28700 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RxraP28700 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RxraP28700 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RxraP28700 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RxraP28700 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RxraP28700 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RxraP28700 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RxraP28700 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RxraP28700 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RxraP28700 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RxraP28700 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RxraP28700 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RxraP28700 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RxraP28700 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RxraP28700 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RxraP28700 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RxraP28700 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RxraP28700 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RxraP28700 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RxraP28700 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RxraP28700 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RxraP28700 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RxraP28700 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RxraP28700 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RxraP28700 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxraP28700 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxraP28700 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxraP28700 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxraP28700 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxraP28700 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxraP28700 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxraP28700 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxraP28700 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxraP28700 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxraP28700 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxraP28700 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxraP28700 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxraP28700 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxraP28700 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RxraP28700 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxraP28700 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxraP28700 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxraP28700 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxraP28700 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxraP28700 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxraP28700 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxraP28700 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxraP28700 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxraP28700 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxraP28700 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxraP28700 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxraP28700 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxraP28700 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxraP28700 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxraP28700 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxraP28700 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxraP28700 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RxraP28700 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxraP28700 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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