Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NapbP28663 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NapbP28663 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NapbP28663 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NapbP28663 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NapbP28663 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NapbP28663 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NapbP28663 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NapbP28663 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NapbP28663 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NapbP28663 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NapbP28663 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NapbP28663 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NapbP28663 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NapbP28663 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NapbP28663 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NapbP28663 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NapbP28663 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NapbP28663 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NapbP28663 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NapbP28663 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NapbP28663 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NapbP28663 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NapbP28663 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NapbP28663 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NapbP28663 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NapbP28663 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NapbP28663 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NapbP28663 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NapbP28663 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NapbP28663 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NapbP28663 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NapbP28663 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NapbP28663 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NapbP28663 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NapbP28663 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NapbP28663 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NapbP28663 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NapbP28663 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NapbP28663 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NapbP28663 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NapbP28663 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NapbP28663 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NapbP28663 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NapbP28663 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NapbP28663 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NapbP28663 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NapbP28663 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NapbP28663 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NapbP28663 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapbP28663 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapbP28663 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapbP28663 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapbP28663 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapbP28663 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapbP28663 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NapbP28663 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapbP28663 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapbP28663 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapbP28663 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapbP28663 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapbP28663 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapbP28663 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapbP28663 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapbP28663 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NapbP28663 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapbP28663 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapbP28663 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapbP28663 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapbP28663 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapbP28663 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapbP28663 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapbP28663 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapbP28663 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapbP28663 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapbP28663 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapbP28663 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapbP28663 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapbP28663 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapbP28663 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapbP28663 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NapbP28663 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapbP28663 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NapbP28663 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapbP28663 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapbP28663 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapbP28663 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapbP28663 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapbP28663 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NapbP28663 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapbP28663 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapbP28663 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapbP28663 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NapbP28663 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapbP28663 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapbP28663 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapbP28663 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapbP28663 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapbP28663 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NapbP28663 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms