Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb7P26011 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itgb7P26011 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb7P26011 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itgb7P26011 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Itgb7P26011 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb7P26011 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Itgb7P26011 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb7P26011 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb7P26011 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb7P26011 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb7P26011 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb7P26011 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Itgb7P26011 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb7P26011 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb7P26011 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb7P26011 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb7P26011 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb7P26011 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb7P26011 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb7P26011 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb7P26011 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb7P26011 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Itgb7P26011 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms