Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UbtfP25976 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UbtfP25976 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UbtfP25976 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UbtfP25976 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UbtfP25976 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UbtfP25976 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
UbtfP25976 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UbtfP25976 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
UbtfP25976 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UbtfP25976 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UbtfP25976 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UbtfP25976 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
UbtfP25976 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
UbtfP25976 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UbtfP25976 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UbtfP25976 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UbtfP25976 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms