Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tap1P21958 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tap1P21958 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tap1P21958 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tap1P21958 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tap1P21958 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tap1P21958 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tap1P21958 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tap1P21958 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms