Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B1P20020 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms