Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a1P19437 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a1P19437 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms