Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata1P17679 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gata1P17679 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms