Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ass1P16460 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ass1P16460 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ass1P16460 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ass1P16460 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ass1P16460 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ass1P16460 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ass1P16460 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ass1P16460 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ass1P16460 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ass1P16460 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ass1P16460 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ass1P16460 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ass1P16460 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ass1P16460 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ass1P16460 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ass1P16460 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ass1P16460 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms