Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gabra6P16305 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabra6P16305 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms