Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARGP13631 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARGP13631 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARGP13631 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RARGP13631 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARGP13631 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARGP13631 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARGP13631 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARGP13631 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RARGP13631 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RARGP13631 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARGP13631 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RARGP13631 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARGP13631 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARGP13631 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARGP13631 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RARGP13631 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARGP13631 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARGP13631 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARGP13631 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARGP13631 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARGP13631 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RARGP13631 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARGP13631 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARGP13631 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARGP13631 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARGP13631 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARGP13631 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARGP13631 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RARGP13631 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RARGP13631 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARGP13631 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARGP13631 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARGP13631 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARGP13631 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARGP13631 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARGP13631 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARGP13631 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARGP13631 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARGP13631 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARGP13631 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARGP13631 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RARGP13631 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RARGP13631 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARGP13631 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARGP13631 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARGP13631 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARGP13631 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARGP13631 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARGP13631 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARGP13631 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RARGP13631 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARGP13631 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RARGP13631 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARGP13631 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARGP13631 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARGP13631 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARGP13631 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARGP13631 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARGP13631 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARGP13631 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RARGP13631 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARGP13631 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARGP13631 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARGP13631 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARGP13631 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARGP13631 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RARGP13631 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARGP13631 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARGP13631 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARGP13631 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARGP13631 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RARGP13631 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARGP13631 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARGP13631 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARGP13631 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RARGP13631 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARGP13631 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARGP13631 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RARGP13631 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RARGP13631 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms