Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctla2aP12399 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctla2aP12399 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms