Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxd4P10628 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxd4P10628 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms