Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms