Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TtrP07309 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtrP07309 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtrP07309 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtrP07309 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TtrP07309 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtrP07309 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtrP07309 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtrP07309 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtrP07309 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtrP07309 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtrP07309 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtrP07309 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtrP07309 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtrP07309 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtrP07309 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtrP07309 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtrP07309 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TtrP07309 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TtrP07309 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtrP07309 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtrP07309 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtrP07309 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TtrP07309 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtrP07309 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtrP07309 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtrP07309 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtrP07309 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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TtrP07309 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtrP07309 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtrP07309 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtrP07309 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtrP07309 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtrP07309 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtrP07309 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtrP07309 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtrP07309 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtrP07309 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TtrP07309 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtrP07309 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
TtrP07309 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtrP07309 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtrP07309 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtrP07309 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtrP07309 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtrP07309 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtrP07309 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtrP07309 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtrP07309 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtrP07309 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TtrP07309 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtrP07309 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtrP07309 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtrP07309 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtrP07309 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtrP07309 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtrP07309 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtrP07309 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtrP07309 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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TtrP07309 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtrP07309 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtrP07309 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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TtrP07309 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtrP07309 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtrP07309 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtrP07309 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtrP07309 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtrP07309 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TtrP07309 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TtrP07309 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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