Protein–RNA interactions for Protein: P03966

Mycn, N-myc proto-oncogene protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MycnP03966 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MycnP03966 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MycnP03966 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MycnP03966 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MycnP03966 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MycnP03966 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MycnP03966 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MycnP03966 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MycnP03966 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MycnP03966 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MycnP03966 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MycnP03966 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MycnP03966 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MycnP03966 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MycnP03966 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MycnP03966 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MycnP03966 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MycnP03966 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MycnP03966 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MycnP03966 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MycnP03966 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MycnP03966 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MycnP03966 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MycnP03966 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MycnP03966 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MycnP03966 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MycnP03966 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MycnP03966 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MycnP03966 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MycnP03966 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MycnP03966 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MycnP03966 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MycnP03966 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MycnP03966 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MycnP03966 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MycnP03966 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MycnP03966 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MycnP03966 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MycnP03966 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MycnP03966 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MycnP03966 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MycnP03966 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MycnP03966 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MycnP03966 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MycnP03966 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MycnP03966 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MycnP03966 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MycnP03966 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MycnP03966 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MycnP03966 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MycnP03966 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MycnP03966 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MycnP03966 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MycnP03966 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MycnP03966 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MycnP03966 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MycnP03966 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MycnP03966 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MycnP03966 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MycnP03966 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MycnP03966 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MycnP03966 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MycnP03966 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MycnP03966 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MycnP03966 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MycnP03966 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MycnP03966 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MycnP03966 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MycnP03966 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MycnP03966 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MycnP03966 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MycnP03966 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MycnP03966 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MycnP03966 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MycnP03966 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MycnP03966 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MycnP03966 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MycnP03966 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MycnP03966 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MycnP03966 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MycnP03966 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MycnP03966 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MycnP03966 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MycnP03966 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MycnP03966 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MycnP03966 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MycnP03966 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MycnP03966 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MycnP03966 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MycnP03966 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MycnP03966 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MycnP03966 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MycnP03966 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MycnP03966 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MycnP03966 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MycnP03966 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MycnP03966 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MycnP03966 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MycnP03966 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MycnP03966 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms